研究揭示兒童癌癥致病基因
來自約翰霍普金斯大學(xué)Kimmel癌癥中心和費(fèi)城兒童醫(yī)院(CHOP)的科學(xué)家們?cè)趯?duì)74個(gè)兒童神經(jīng)母細(xì)胞瘤進(jìn)行全基因組測(cè)序后,發(fā)現(xiàn)ARID1A和ARID1B兩個(gè)基因發(fā)生改變的患兒相比無此基因改變的患兒生存期縮短了四分之三。這一發(fā)現(xiàn)有可能最終導(dǎo)致早期確認(rèn)患有侵襲性神經(jīng)母細(xì)胞瘤的兒童,他們或許需要接受其他的治療。相關(guān)論文發(fā)表在12月2日的《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。
神經(jīng)母細(xì)胞瘤累及全身神經(jīng)組織,是最常見的一種兒童惡性實(shí)體瘤。約翰霍普金斯大學(xué)癌癥生物學(xué)計(jì)劃聯(lián)合主任、腫瘤學(xué)教授Victor Velculescu 博士說:“這些癌癥具有廣泛的臨床結(jié)局,一些治愈的機(jī)會(huì)很高,而另一些則是相當(dāng)致命的。出現(xiàn)這種預(yù)后多樣性,部分原因可能是由于ARID1A和ARID1B基因的改變。”
Velculescu說在以往其他的神經(jīng)母細(xì)胞瘤基因測(cè)序研究中沒有發(fā)現(xiàn)這些強(qiáng)大的“惡棍”(bully)基因。新研究能鑒別出它們,很有可能是因?yàn)榧s翰霍普金斯大學(xué)CHOP的研究人員采用測(cè)序和分析方法,除找到了單個(gè)堿基對(duì)序列的改變,還篩查了DNA更大的結(jié)構(gòu)重排。
在本研究的74個(gè)腫瘤中,有71個(gè)進(jìn)行了重排和堿基對(duì)改變分析。研究人員在過去顯示與神經(jīng)母細(xì)胞瘤有關(guān)聯(lián)的多個(gè)基因,包括ALK和MYCN基因中發(fā)現(xiàn)了癌癥特異性的突變。他們還發(fā)現(xiàn)71名患者中8人有ARID1A和ARID1B基因的改變,這兩個(gè)基因通常情況下通過調(diào)控DNA折疊方式來影響蛋白質(zhì)合成。
具有ARID1A和ARID1B基因改變的兒童平均生存期只有386天,相比之下沒有這些遺傳變異的兒童則達(dá)到1,689天,兩者相差甚遠(yuǎn)。然而除一人之外,所有這些患者均死于侵襲性疾病,包括一名被認(rèn)為治愈機(jī)會(huì)很高的神經(jīng)母細(xì)胞瘤患兒。
在本研究中,科學(xué)家們還檢測(cè)和監(jiān)控了四名患者血液中神經(jīng)母細(xì)胞瘤特異性的遺傳改變,并將確定了這些調(diào)查結(jié)果與疾病進(jìn)程之間的相互關(guān)聯(lián)。
“在血液中尋找癌癥特異性的改變,可能有助于臨床醫(yī)生監(jiān)控患者的復(fù)發(fā)情況,確定手術(shù)后體內(nèi)是否還有殘留癌細(xì)胞,”本研究的首席科學(xué)家之一、約翰霍普金斯大學(xué)研究生Mark Sausen說。
約翰霍普金斯大學(xué)CHOP研究小組計(jì)劃在更大規(guī)模組群患者中開展進(jìn)一步地研究,以證實(shí)ARID1A-ARID1B與預(yù)后相關(guān)。